各军见状，就出兵夹击援助，农民军大败，伏尸遍野，残余的农民军逃往桐川桥去了。曹文诏率领曹变蛟、冯举、张嘉谟及参将方茂功等追上他们，冲锋陷阵，拼命厮杀，农民军又大败。
不久曹文诏与宁夏总兵贺虎臣、固原总兵杨麒在甘泉虎兕凹打败农民军，大获全胜。
总兵洪承畴在平凉斩了满天飞，降服其将领白广恩，其余的农民军分路逃窜了。曹文诏赶到陇州、平凉、凤翔之间追歼他们。这年十月，三次战斗三败农民军。接着就逼向耀州锥子山的农民军，其党羽杀死独行狼、郝临庵后投降了。洪承畴杀了其中四百多人，其余的遣散回家。关中的农民军这下子略略被剿平了。
巡抚御史范复粹在递给朝廷的奏章中总计历次战斗中共获首级三万六千六百多，曹文诏的功劳第一，张嘉谟第二，王承恩、杨麒又在其次。
虽然曹文诏在陕西时，大小几十次战斗，立功最多，洪承畴却没有给他记功。巡按御史吴甡十分推崇曹文诏，又再次上书汇报，但兵部还是压低他的功绩，最后还是没有给曹文诏论功行赏，此事让曹文昭心中对洪承畴也是多有不满。
在这个时候，农民军看到陕西兵力强盛，于是在崇祯四年的年底就大都流入山西，他们的首领紫金梁、混世王、姬关锁、八大王、曹操、闯塌天、兴加哈利分别统帅七大营部。每部人数多的有一万人，少的也有五千人，在汾州、太原、平阳等地肆意活动。
洪承畴率领重兵去山西继续追剿农民军，曹文昭还在陕西西部清剿残余势力。
御史张宸极上书朝廷说:“贼寇是从陕西来的。陕西将领曹文诏素有威名，士绅百姓为他编歌谣称赞说:'军中有一曹，西贼闻之心胆摇。'而且他曾经在山西立过功，陕西的贼寇已消灭殆尽，应该下令让他进入山西帮助围剿贼寇。“于是朝廷命令山西、陕西的各位将领一同受曹文诏指挥。
曹文昭才收到朝廷旨意没有几天时间，队伍还没有来得及启程，就收到了榆林和延安被贼军攻破，贼军收编了榆林镇的兵马，现在一部向南直奔黄河沿岸，另一部西进攻击庆阳。
远水解不了近渴，曹文昭当机立断，整顿兵马转道庆阳，先解庆阳之围再做打算，两万人马浩浩荡荡的赶到郴州时，就传来消息，庆阳已破，接着就是潼关被破的消息。
曹文昭紧急将队伍停驻在彬县等待进一步消息，和众将商议对策。
没过多久洪承畴的信使到来，看过书信之后，虽然曹文昭因为之前的事情对洪承畴心里很不爽，但这毕竟是国事，写下书信打发走信使之后，曹文昭马上行文固原镇总兵杨麒，让其率领固原镇兵马东进，和自己两面夹击共破庆阳贼军。
固原镇总兵杨麒接到文书之后，抽点精锐士卒两万余人，经彭阳、镇原县东进；曹文昭则率领麾下两万兵马，经宁州北进庆阳，两军在庆阳城南汇合夹击庆阳县。
而从延安方向也有一支兵马正在急速向着庆阳而来。
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